GOplot的GOcluster图
简介
该图使用圆形聚类形式展示富集结果，外圈是每个基因所在的GO term堆叠柱状图，中圈为log2FC值，内圈为cluster。注意：1，结果中所有基因均转成大写了；2，最多绘制18个GO term。3，结果中z-score（不是常规的统计z-score，仅给一个term是更可能降低（负值）或升高（正值）的暗示，计算方法：(up基因数-down基因数)/sqrt(基因数)，例如positive regulation of cytokine production的Zscore = (5-8)/sqrt(13)=-0.83。参考R包：GOplot
数据说明
输入数据包括2个。第一个是富集结果，包括5列：GO id，GO term描述，分类，genes，adj_pval（此列未用在图中，但需要有）；第二个是每个基因及基因的log2fc。两个数据必需保持一致（第二个可以输入全部的基因，程序会根据第一个输入的基因自动挑选）。
论文例子
The establishment of a prognostic scoring model based on the new tumor immune microenvironment classification in acute myeloid leukemia. Fig3 C
如何引用？
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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Oct 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.
