用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

人工客服   基因名转换   FC,P转换   常用配色 需求及bug提交   pdf转图片
必需输入
原始表达矩阵(行是基因,列是样品),仅支持human
数据较少,直接粘贴

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文,不能超过10M)

数据来源平台



此分析将消耗 1 微币

根据表达谱进行肿瘤纯度计算

简介
原理:利用预先收集好的免疫基因集和基质基因集,通过ssGSEA算法计算每个样本各自基因集的得分。本模块以表达谱为输入,调用estimate R包进行基质细胞打分(StromalScore),免疫细胞打分(ImmuneScore),综合打分(ESTIMATEScore,基质细胞打分和免疫细胞打分的和),肿瘤纯度(TumorPurity)计算
输入数据
输入为表达谱矩阵。行为基因,列为样品,不能有空的单元格。
论文例子
示例 示例数据
输出 输出包括5列:1,样品名;2,stromscore;3,immuscore,4,estimatescore,5,tumor purity。
可以使用这些得分将样品重新分组,计算差异表达等一系列下游分析。

如何引用?

建议直接写网址。4400+篇google学术,3700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Oct 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.