生物信息学数据分析服务

常见个性化分析列表

GEO相关服务
1，芯片数据挖掘。根据芯片类型，计算表达谱，差异基因等
2，高通量测序数据挖掘。根据测序类型，计算表达谱，差异或者peak calling等
3，多组学数据联合分析
4，GEO原始数据上传/下载

TCGA相关服务
1，特定癌症的表达谱，差异分析
2，Cox回归，生存分析
3，预后模型
4，免疫浸润

转录组相关
1，GSEA/GSVA分析
2，CNC共表达网络分析
3，ceRNA网络分析，包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络，circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络等
4，WGCNA分析
5，GO，Pathway分析，常规物种和特殊物种
6，蛋白质-蛋白质相互作用分析
7，hub基因分析
8，circRNA同源分析
9，时序表达分析
10，Venn图
11，PCA分析

测序服务：mRNA-seq

小RNA相关
1，miRNA靶基因预测
2，miRNA-靶基因网络分析
3，miRNA二级结构分析
4，piRNA靶基因预测
测序服务：miRNA-seq

ChIP、MeDIP相关
1，峰可视化
2，motif分析
3，circos图

MeRIP/m6A相关
1，m6A和RNA-seq联合分析四象限图
2，相关系数
3，peak venn图
4，circos图
5，motif分析
6，metaplot

eccDNA相关
1，eccDNA长度分布
2，motif分析
3，染色体分布
4，不同基因组特征分布

其他联合分析
1，RNA-seq和MeRIP-seq联合分析
2，miRNA-seq和circRNA-seq联合分析
3，mRNA-seq和eccDNA-seq联合分析

个性化作图、分析相关
1，提供论文例图定制开发
2，提供数据，测试程序等

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