用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  带分割的矩阵热图绘制视频
请勿上传超过5000行的矩阵
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)

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颜色个数(越大越平滑):

cut成几部分(1则不cut)
行聚类树cut:
列聚类树cut:


聚类方法



距离方法



回调函数 注:新版与标注某几个基因模块一致


scale方向(z-score转化)


显示行名


显示列名


是否去除表达值完全一样的行(默认去除)


colorbar颜色范围(不填则默认)
从小到大写,英文逗号分隔,例如-2,-1,0,1,2


字体


此图将消耗 4 微币

带聚类树自动分割(cut)的热图

简介
根据预设值的切割数,将聚类热图根据层次聚类结果用空白线进行分割,调用pheatmap R包
数据说明
第一行为样品名字。第一列是基因名,其余为数据。数据进行双向聚类,并输出每行、每列所在的cluster(可以通过搜索pdf图上的名字,来确定结果cluster数字在图上的位置,然后使用其他热图模块重新绘图)
注意:1,若基因有重名的,取均值;样品也不能有重名的。2,制表符分隔,可以在excel中做转化(例如log2等,这里默认数据已经处理好),然后贴过来。
论文例子
输入 示例数据
输出

如何引用?

建议直接写网址。4400+篇google学术,3700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Oct 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.