用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入  三颜色火山图视频教程
数据较少(直接拷贝数据并粘贴到输入框,带header):

数据较多(上传tab分割的txt文件,文件名用英文)

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文字大小
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图例legend文字大小:
标注的基因名文字大小:

颜色
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下调颜色:
无变化颜色:
分隔线颜色:
点颜色透明度:

阈值及其他
P最小值(例如小于1e-100的p值被设置为1e-100,最小支持1e-323):
倍数变化阈值(必需>1):
P值或FDR等阈值:
marker点大小:
X轴最小值:;X轴最大值:
Y轴最大值(最小值默认0):

点(marker)形状


网格


待标注基因(一行一个,必需在第一列中,大小写敏感)


基因名到点的距离(名字和点间带不带线,非0则带线)
X方向:;Y方向:
待标注基因名颜色:

字体


火山图(volcano plot)

简介
形如火山喷发,向两侧越来越宽,故名。
数据说明
数据包括3列,第1列是基因名,或者miRNA名,circRNA名字等,必需唯一;第2列是log2fc,上调>=0,下调<0,不能为空,inf,-inf;第3列为p值或fdr值,不能为空,NA等
注意:1,X轴是log2的,一般不超过15,若超过15,请检查输入数据!
论文例子
Identification of Gene Expression Changes Associated With Uterine Receptivity in Mice Fig 1A.
文章写作
Volcano plot of differentially expressed genes between cancer and normal. Red dots represents upregulated genes, blue dots represents downregulated genes, and gray dots represent genes that were not differentially expressed (P < 0.05, |logFC|>1.0).
输入 示例数据
输出

如何引用?

建议直接写网址。4800+篇google学术,3900+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.