用前必读
1,使用excel存储并调整数据,然后拷贝、粘贴到输入框
2,先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入,通过后再作图
3,表头请勿使用#,<,>,%,(,)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4,使用inkscape或者AI修改文字、字体,图例,处理截断
5,生信项目合作,提交bug、发文引用换积分,请加管理员微信(页面右下)

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必需输入
(1)基因-通路ID,将vps换成自己的物种缩写


(2)通路ID-通路名,将vps换成自己的物种缩写


(3)差异基因(一行一个,名字必需是(1)里边的基因名


可选输入
纳入分析的通路(包含的基因数)
最小基因数:;最大基因数:

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KEGG数据库中任意物种的通路富集分析

简介
KEGG数据库中包含近8000种物种,可以根据KEGG数据库中基因-通路,通路-通路名的对应关系,利用clusterProfiler的enrichr函数对kegg中任意物种的通路进行富集分析。
数据说明
输入数据包括3个:1)基因-通路对应关系;2)通路-通路名对应关系,其中vps为待分析物种的字母缩写,需要换成你自己的物种缩写(见:KEGG物种);3)差异基因列表(必需是来自(1)里边的基因)。默认输出全部结果,可以使用微生信网站其他模块进行绘图。
论文例子
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输出

如何引用?

建议直接写网址。4400+篇google学术,3700+篇知网学术
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Oct 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.